Tính từ 16h ngày 05/4 đến 16h ngày 06/4, trên Hệ thống Quốc gia quản lý ca bệnh COVID-19 ghi nhận 49.124 ca nhiễm mới, trong đó 0 ca nhập cảnh và 49.124 ca ghi nhận trong nước (giảm 5.871 ca so với ngày trước đó) tại 61 tỉnh, thành phố (có 35.177 ca trong cộng đồng).
Các tỉnh, thành phố ghi nhận ca bệnh như sau: Hà Nội (4.037), Nghệ An (2.302), Phú Thọ (2.257), Yên Bái (2.230), Bắc Giang (2.160), Đắk Lắk (2.064), Quảng Ninh (1.968), Lào Cai (1.760), Vĩnh Phúc (1.590), Quảng Bình (1.494), Bắc Kạn (1.406), Bắc Ninh (1.357), Lạng Sơn (1.287), Tuyên Quang (1.167), Thái Bình (1.115), TP. Hồ Chí Minh (1.075), Cao Bằng (997), Thái Nguyên (977), Hải Dương (945), Hưng Yên (942), Hà Giang (902), Vĩnh Long (819), Sơn La (787), Lai Châu (781), Lâm Đồng (765), Quảng Trị (718), Bến Tre (702), Tây Ninh (691), Hà Tĩnh (651), Cà Mau (638), Hòa Bình (612), Bình Định (593), Hà Nam (570), Nam Định (569), Ninh Bình (563), Đà Nẵng (539), Bình Phước (526), Điện Biên (506), Bình Dương (413), Thừa Thiên Huế (399), Bà Rịa - Vũng Tàu (352), Phú Yên (312), Đắk Nông (276), Hải Phòng (271), Thanh Hóa (268), Quảng Nam (248), Trà Vinh (224), Bình Thuận (218), Khánh Hòa (184), Kiên Giang (162), An Giang (146), Đồng Nai (136), Bạc Liêu (114), Long An (108), Sóc Trăng (78), Kon Tum (47), Ninh Thuận (35), Đồng Tháp (32), Cần Thơ (17), Hậu Giang (17), Tiền Giang (5).